1：采用隧道式结构设计。

2：杀菌时食用菌培养基需适度含水量７０－７５％。

3：袋品适度松开，避免袋子涨破。

食用菌培养基在微波的辐照杀菌下，在隧道内停留５－１０进行杀菌。微波培养基杀菌设备能对食用菌培养基进行彻底的杀菌，效率高，工艺一致性大大提高，可以实现机械化甚至自动化操作，具有很好的社会价值和经济价值，易于推广应用。微波培养基杀菌设备杀菌时间短，温度低，最关键的是避免培养基中的糖类、蛋白质、琼脂等等会逐步分解，可导致培养基性能降低。

微波杀菌是通过特殊热和非热效应杀菌，与常规热力杀菌比较，能在比较低的温度和较短的时间获得所需的消毒杀菌效果。实践证明，一般杀菌温度在75-80摄氏度就能达到效果，此外，微波处理食品能保留更多的营养成分和色、香、味、形等风味，且有膨化效果。如常规热力处理的蔬菜保留的维生素C是46-50％，而微波处理是60-90％，常规加热猪肝维生素A保持为58％，而微波加热为84％。
2、节约能源：常规热力杀菌往往在环境及设备上存在热损失，而微波是直接对食品进行作用处理，因而没有额外的热能损耗。相比而言，一般可节电30-50％。
3、均匀彻底：常规热力杀菌是从物料表面开始，然后通过热传导传至内部。存在内外温差。为了保持食品风味，缩短处理时间，往往食品内部没有达到足够温度而影响杀菌效果。。

由于微波具有穿透作用，对食品进行整体处理时，表面和内部都同时受到作用，所以消毒杀菌均匀、彻底。

4、便于控制:微波食品杀菌处理，设备能即开即用，没有常规热力杀菌的热惯性，操作灵活方便，微波功率能从零到额定功率连续可调、传输速度从零开始连续调整，便于控制。
5、设备简单，工艺先进:与常规消毒杀菌相比，微波杀菌设备不需要锅炉、复杂的管道系统、煤场和运输车辆等，只要具备水、电基本条件即可。