微波干燥设备主要应用于鲜花、食品、化工、调味品、制药、生物制品、制药、木材、纸业、制茶等行业的干燥杀菌。
微波加热是使被加热物体本身成为发热体，称之为整体加热方式，不需要热传导的过程，因此能在短时间内达到均匀加热。这一特点可使热传导较差的物质在短时间内得到加热干燥，能量的利用率得到提高，还可以使加热炉的尺寸比常规加热炉要小。同时，当物料在微波电磁场作用下，物料整体温度上升。此时，由于物料表面水份蒸发，致使表面温度降低；从而造成一个内高外低的温度梯度，这个梯度的方向正好与水份蒸发的方向一致。所以效率极高。
微波干燥设备绝大多数都是非标设备，主要是因为每台干燥设备所处理的物料都不相同，很多干燥条件都随物料的不同而改变，由此导致干燥器结构及材料的改变。所以必需明确待干燥物料的具体参数，如物料状态、所含湿分种类、处理量、干燥过程中物料特性、如有无腐蚀性、燃烧和爆炸性、是否产生静电、产品具体要求、物料的热敏性温度等，才能确定干燥器的各种参数。为此许多干燥器都不能批量生产，在设计过程中必需注意对物料的针对性和对工作条件的适应性。 
