简单地说微波杀菌、保鲜是微波热效应和非热效应共同作用的结果。微波的热效应主要起快速升微波杀菌温度仅在７０至９０度，时间约为几分钟。温杀菌作用；而非热效应则使用微生物体内蛋白质和生理活性物质发生变异，而丧失活力或死亡。因此，微波杀菌温度低于常规方法，一般比较，常规方法杀菌温度要在１００度以上，时间要在十几分钟至几十分钟，而
微波杀菌优点：
1. 时间短。速度快：常规热力杀菌是通过热传导方式将热量从食品表面传至内部，往往需较长时间，内部才能达到杀菌温度。微波则利用其透射作用，以热效应和非热效应的共同作用，是物品内外均匀的，迅速升温杀灭细菌。处理时间大大缩短，在强功率密度强度下，甚至只要几秒~数十秒达到满意效果。
2.低温杀菌，保持药品成分：微波热效应的快速升温和非热效应的生化作用，增强了杀菌功能。相比常规热力在比较低温的温度，较短的时间内就能获得灭虫菌的效果，一般杀菌温度在75~80，处理时间3~5分钟。
